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レアバリアントが高リスクのとき、フェノタイプと関係性があるとでて、レアバリアントが低リスクのとき、フェノタイプと関係性がないという結果が出したい。
この高リスク、低リスクは、CVに比べて、というものなので、CVについてもう少し考えて組み込んで、リサンプリングの人数のところからやり直す。

多分CVに与えるリスクを上手いこと設定すると上手くいく感じがする。

今までのを無駄にしないなら、リスクを0でなく、RVに与えるもののうち最小のもの、という風にすると、モデルがあまり変わらず、いい結果が出そう。