十分な人数、十分なバリアントでリスクの与え方を変えたいのだが、人数を2倍にすると4倍くらいの時間がかかる気がする。どのくらいにするか難しいところ。1000人、RV150個で、大体72秒。あるkrについて100回試行して2時間。

距離のはかり方をなんとなくmanhattanからeuclidにしてみたら上手くいきそうな感じ。。。。manhattanでCVをちょっと増やすとかより、こっちの違いについて考えるのが重要な感じがする。euclidで色々な条件で試してみて、それで上手くいくならそれでいいし、…

サンプルを200人とってきて、こういったRVセットについて考える、としたとき、どんなRVを選んで調べて見てもいいのだから、アレル頻度のところは実際は融通がききそうな気がしてきた。といっても、みつかるRVのアレル頻度は指数分布に従うだろうから、10-50%…